SEGI LIMA : Bermakna menjunjung tinggi Pancasila sebagai falsafah dan pandangan hidup bangsa Indonesia

WARNA DASAR BIRU : Bermakna bahwa warga sekolah dapat diandalkan dan bertanggungjawab, bersifat dinamis sehingga sangat sesuai dengan tujuan sekolah

ABHIWARA ASMARA TANTRA : Bermakna tempat yang mulya untuk menuntut ilmu

BINTANG KUNING : Bermakna bahwa warga sekolah diharapkan dapat berprestasi gemilang dan dapat menjadi penerang bagi warga sekitar.

WARNA HIJAU : Bermakna letak geografis SMPN 2 Pakis yang terletak di daerah persawahan dan perkebunan

TUGU, PENA dan BUKU : Bermakna mempunyai cita-cita yang tinggi dan semangat untuk menuntut Ilmu Pengetahuan

RANTAI : Bermakna persatuan dan kebersamaan yang terjalin kuat diantara warga sekolah

TULISAN SMPN 2 PAKIS : Bermakna kepemilikan logo dan organisasi pendidikan yang resmi